趙應(yīng)元（1531年—1584年），字文宗，號仁齋，又號肖鶴，陜西三原縣籍涇陽縣人。

同進(jìn)士出身。

嘉靖四十年辛酉科陜西鄉(xiāng)試第六十一名，四十四年（1565年）登乙丑科會試二百十九名，廷試三甲三十九名進(jìn)士，戶部觀政，本年六月授四川華陽縣知縣，丁憂。

隆慶三年（1569年）復(fù)補(bǔ)河南郟縣知縣，五年（1571年）八月考選浙江道御史，六年十一月差巡按遼東，萬歷元年（1573年）八月丁憂。

四年六月復(fù)除河南道御史，八月差巡按湖廣。

張居正父喪，湖廣官員畢至，唯獨(dú)應(yīng)元不至，張居正心中不悅。

都御史陳炌順張居正意，彈劾趙應(yīng)元。

萬歷六年（1578年）五月，趙應(yīng)元被迫棄官還鄉(xiāng)。

張居正卒后，經(jīng)四川道御史孫繼先舉薦，萬歷十一年（1583年）二月恢復(fù)河南道御史官職，十二年三月升南京大理寺右寺丞，同年卒于任上。